Nat Genet： 人类所癌症中病毒分布

德国胃癌研究中心 Peter Lichter 工作团队最新研究探讨了人类文明胃癌中菌株的分布。日前《纯净—遗传学家》离线撰写了这一科研成果。

作为泛癌以外基因序列量化联盟的一部分，该文档抽取了 38 个特性的 2658 例胃癌结果显示的以外基因序列和一部分磷酸化以外基因序列基因组统计数据，研究部门利用共识的新方法，拆分了 3 个独立文档用以系统地研究潜在的菌株细菌。在 382 个基因序列和 68 个磷酸化组统计数据集中都监测到了菌株普遍存在。研究发现，已知的与之外的菌株，如艾克—布鲁克菌株（EBV）、乙型肝炎菌株（HBV）和人瘤菌株（HPV）的检出率都很较高。

这项研究揭示了头颈癌中 HPV 和转子特异性的在在排他性以及 HPV 与 APOBEC 突变特性的持续性，这表明特异性战斗能力下降是宫颈癌、胰脏和头颈癌的某种程度。对于 HBV、HPV16、HPV18 和腺之外菌株 2，菌株拆分与基因序列拷贝数的连续性推移有关。在 TERT 启动子处的拆分与原核的较高解读有关，从而明显激活了该的发育流程。诱发逆磷酸化菌株的较高解读与肾癌患者较差的生存期有关。

原始出处：

Zapatka， M.， Borozan， I.， Brewer， D.S. et al. The landscape of viral associations in human cancers. Nat Genet (2020). https：//doi.org/10.1038/s41588-019-0558-9.